System.out.println() / System.err.println() / System.in

// 標準出力に改行付きで出力します。
System.out.println(値);

// 標準出力に改行なしで出力します。
System.out.print(値);

// 書式指定で出力します（printfと同様）。
System.out.printf(String format, Object... args);

// 標準エラー出力に出力します（赤字で表示されます）。
System.err.println(値);
System.err.print(値);

// 標準入力からキーボード入力を受け取ります。
Scanner scanner = new Scanner(System.in);
String line  = scanner.nextLine();   // 1行読み込みます。
int num       = scanner.nextInt();   // 整数を読み込みます。
double d      = scanner.nextDouble();// 小数を読み込みます。
scanner.close(); // 使い終わったらクローズします。

// println() で各型の値を出力します。
System.out.println("文字列");    // 『文字列』と出力されます。
System.out.println(42);          // 『42』と出力されます。
System.out.println(3.14);        // 『3.14』と出力されます。
System.out.println(true);        // 『true』と出力されます。
System.out.println(null);        // 『null』と出力されます。

// print() で改行なしに出力します。
System.out.print("A");
System.out.print("B");
System.out.println("C"); // 『ABC』と1行で出力されます。

// printf() で書式付き出力を行います。
String name = "Alice";
int age = 30;
System.out.printf("名前: %s、年齢: %d歳%n", name, age); // 『名前: Alice、年齢: 30歳』と出力されます。
System.out.printf("円周率: %.4f%n", Math.PI);             // 『円周率: 3.1416』と出力されます。

// err.println() でエラーメッセージを出力します。
try {
    int result = 10 / 0;
} catch (ArithmeticException e) {
    System.err.println("エラーが発生しました: " + e.getMessage());
}

// Scanner で標準入力からデータを受け取ります。
import java.util.Scanner;
Scanner sc = new Scanner(System.in);
System.out.print("名前を入力してください: ");
String input = sc.nextLine();
System.out.println("こんにちは、" + input + "さん！");
sc.close();

System.out は PrintStream 型の静的フィールドで、標準出力に接続されたストリームです。同様に System.err は標準エラー出力に接続されており、エラーメッセージは System.out とは別のストリームに流れます。

書式指定の主なフォーマット文字は %s（文字列）・%d（整数）・%f（浮動小数）・%.2f（小数点以下2桁）・%n（改行）です。本番アプリケーションでは System.out.println() の代わりに java.util.logging や SLF4J などのロギングライブラリを使うことが推奨されます。

時間計測には『System.currentTimeMillis() / System.nanoTime()』を参照してください。